目前，股權(quán)轉(zhuǎn)讓繳納印花稅主要分兩種情況：

1.一般企業(yè)之間股權(quán)轉(zhuǎn)讓繳納印花稅適用稅率為萬分之五。根據(jù)《印花稅暫行條例》及施行細則的規(guī)定，產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)，是指單位和個人產(chǎn)權(quán)的買賣、繼承、贈與、交換、分割等所立的書據(jù)。《國家稅務(wù)局關(guān)于印花稅若干具體問題的解釋和規(guī)定的通知》(國稅發(fā)〔1991〕155號)規(guī)定，財產(chǎn)所有權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)的征稅范圍是：經(jīng)政府管理機關(guān)登記注冊的動產(chǎn)，不動產(chǎn)的所有權(quán)轉(zhuǎn)移所立的書據(jù)，以及企業(yè)股權(quán)轉(zhuǎn)讓所立的書據(jù)。適用稅率按所載金額萬分之五貼花，同時《印花稅暫行條例施行細則》第十六條規(guī)定，產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)由立據(jù)人貼花，如未貼或者少貼印花，書據(jù)的持有人應(yīng)負責補貼印花所立書據(jù)以合同方式簽訂的，應(yīng)由持有書據(jù)的各方分別按全額貼花。

2.上市公司股權(quán)轉(zhuǎn)讓繳納印花稅時適用3‰的稅率。這里的上市公司是指在上海證券交易所、深圳證券交易所掛牌交易的上市公司。 根據(jù)財稅[2005]11號文件規(guī)定，買賣、繼承、贈與所書立的A股、B股股權(quán)轉(zhuǎn)讓書據(jù)，由立據(jù)雙方當事人分別按1‰的稅率，按照“股權(quán)轉(zhuǎn)讓書據(jù)”交納印花稅。2007年5月30日，該稅率已經(jīng)由1‰調(diào)整為3‰.《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整證券(股票)交易印花稅稅率的通知(財稅〔2007〕84號)規(guī)定，經(jīng)國務(wù)院批準，從2007年5月30日起，調(diào)整證券(股票)交易印花稅稅率。對買賣、繼承、贈與所書立的A股、B股股權(quán)轉(zhuǎn)讓書據(jù)，由立據(jù)雙方當事人分別按3‰的稅率繳納證券(股票)交易印花稅。這里的證券交易印花稅是從普通印花稅發(fā)展而來的，是專門針對股票交易發(fā)生額征收的一種稅，是投資者從事證券買賣所強制繳納的一筆費用。證券交易印花稅的征稅對象是企業(yè)股權(quán)轉(zhuǎn)讓書據(jù)和股份轉(zhuǎn)讓書據(jù)，納稅義務(wù)人是股份轉(zhuǎn)讓雙方，并由證券交易所代扣代繳。計稅依據(jù)是雙方持有的成交過戶交割單。

外商投資者境內(nèi)企業(yè)股權(quán)境外交易也應(yīng)繳納印花稅。

根據(jù)財稅【1988】255號、國稅發(fā)【1991】155號文件規(guī)定，在中華人民共和國境內(nèi)書立、領(lǐng)受本條例所列舉憑證的單位和個人（包括……外國公司企業(yè)和其他經(jīng)濟組織及其在華機構(gòu)等單位和個人），都是印花稅的納稅義務(wù)人。上述憑證無論在中國境內(nèi)或者境外書立，均應(yīng)依照條例規(guī)定貼花。印花稅暫行條例列舉征稅的合同在國外簽訂時，不便按規(guī)定貼花時，應(yīng)在帶入境內(nèi)時辦理貼花完稅手續(xù)。

并且外商投資者境外交易股權(quán)只是在境外付款，必須在境內(nèi)辦理審批和變更登記手續(xù)。所以該股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議應(yīng)該在帶入境內(nèi)時按規(guī)定的稅率貼花。